Dưới sự chỉ đạo của John D. Spreckels cộng với sự ủng hộ của Edward Henry Harriman trước sự thúc giục của Tổng thống Theodore Roosevelt, việc xây dựng tuyến đường sắt Đông San Diego và Arizona bắt đầu vào năm 1907.[13][14] Các kỹ sư cho rằng tuyến đường này là "bất khả thi" khi nó băng qua sa mạc Colorado và qua dãy núi Jacumba.[11] Mặc dù vậy, đến năm 1919, tuyến đường này vẫn hoàn thành, kết nối San Diego với Thung lũng Imperial, băng qua México. Trước khi có đường sắt này, tuyến đường sắt duy nhất đến San Diego là từ phía bắc, qua Los Angeles, hoàn thành vào cuối thế kỷ 19.[15][16] Tuyến đường sắt mới dự kiến sẽ kết nối với Đường sắt Nam Thái Bình Dương, thay vì hướng về phía bắc trên tuyến Đường sắt Atchison, Topeka and Santa Fe.[17] Khi tuyến đường sắt khánh thành (chưa có cầu Goat Canyon), cây cầu quan trọng nhất trên tuyến đường là Cầu cạn Campo Creek, dài 600 foot (180 m) và cao 200 foot (61 m).[18]

Đường sắt San Diego and Arizona đã trải qua một loạt khó khăn, bao gồm các đường hầm bị sập và lở đá, khiến tuyến đường phải đóng cửa định kỳ. Tháng 3 năm 1932, đường hầm số 15 bị sập sau một trận động đất.[8][19] Phần còn lại của nền móng ban đầu vẫn có thể nhìn thấy được đến ngày nay.[20]